Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPAP49450 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPAP49450 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPAP49450 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPAP49450 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPAP49450 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms