Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms