Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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