Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms