Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms