Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACGP22612 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms