Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF3P20783 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF3P20783 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF3P20783 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms