Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5AP20339 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms