Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDSP20132 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDSP20132 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDSP20132 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDSP20132 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDSP20132 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDSP20132 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDSP20132 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDSP20132 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDSP20132 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDSP20132 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDSP20132 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms