Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XBP1P17861 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XBP1P17861 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XBP1P17861 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XBP1P17861 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms