Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMC1P11047 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms