Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms