Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms