Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPLP1P05386 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPLP1P05386 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms