Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDN1P05305 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDN1P05305 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDN1P05305 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDN1P05305 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDN1P05305 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDN1P05305 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDN1P05305 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms