Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms