Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms