Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV1-17P01599 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms