Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA3O96018 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA3O96018 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA3O96018 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA3O96018 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms