Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F6O75461 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F6O75461 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F6O75461 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F6O75461 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F6O75461 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms