Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAMP4O75379 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms