Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARPC1BO15143 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARPC1BO15143 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms