Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms