Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DFFAO00273 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DFFAO00273 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DFFAO00273 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms