Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms