Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms