Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 COL14A1-201ENST00000247781 3450 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX1-203ENST00000428214 3681 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CELP-202ENST00000421286 1125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091675.1-201ENST00000486251 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB8-211ENST00000539528 839 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02304-201ENST00000554445 445 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027237.2-201ENST00000558702 391 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026826.2-201ENST00000560455 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087222.1-201ENST00000571113 504 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011477.1-201ENST00000591884 544 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016590.2-201ENST00000592319 375 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PINLYP-207ENST00000612042 914 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP16-208ENST00000616685 472 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A8-201ENST00000311438 1716 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A14-215ENST00000612248 1734 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms