Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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