Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNE1-206ENST00000432085 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GBAP1-201ENST00000368374 1873 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY1A3-204ENST00000455639 2631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CCR4-201ENST00000330953 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL19-201ENST00000225430 732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CSHL1-202ENST00000309894 669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM136BP-201ENST00000428729 417 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BMF-203ENST00000431415 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012065.1-201ENST00000441870 686 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099541.1-201ENST00000453828 670 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms