Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HCAR1-201ENST00000432564 4768 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf66-AS2-201ENST00000505663 2162 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NOBOX-202ENST00000483238 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PLP1-223ENST00000621218 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SUSD4-207ENST00000484758 2736 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205 ms