Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms