Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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SNX13Q9Y5W8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNX13Q9Y5W8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNX13Q9Y5W8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNX13Q9Y5W8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNX13Q9Y5W8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SNX13Q9Y5W8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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