Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSSC4Q9Y5U2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms