Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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