Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSEQ9Y251 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms