Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms