Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms