Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms