Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS4AQ9UN37 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS4AQ9UN37 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms