Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms