Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STAG3Q9UJ98 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STAG3Q9UJ98 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms