Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms