Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms