Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms