Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFT172Q9UG01 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT172Q9UG01 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms