Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DBF4Q9UBU7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms