Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms