Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP39A1Q9NYL5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP39A1Q9NYL5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms