Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms