Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2AIPQ9NXV6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms